走進(jìn)科技抗“疫”一線(xiàn):3個(gè)“疾控人”的40天
來(lái)源:中國(guó)網(wǎng) 時(shí)間:2020-02-28 12:58:20 編輯:陳姝悅
為抗擊新冠肺炎,成都啟動(dòng)首批8個(gè)應(yīng)急科技攻關(guān)項(xiàng)目,成都市疾控中心承擔(dān)的“成都地區(qū)新型冠狀病毒疫情應(yīng)急響應(yīng)模式的構(gòu)建及應(yīng)用”即是其中之一。構(gòu)建成都市新型冠狀病毒肺炎病例及密切接觸者實(shí)時(shí)采集分析系統(tǒng)、掌握成都市新冠疫情的流行特征、探索成都市新冠病毒肺炎的時(shí)空分布規(guī)律……這些,都是這個(gè)應(yīng)急科技攻關(guān)項(xiàng)目中的重要組成部分。
如今,作為抗擊新冠肺炎的“排頭兵”的疾控人,正在和時(shí)間賽跑,在一線(xiàn)戰(zhàn)“疫”的同時(shí),群策群力推動(dòng)應(yīng)急科技攻關(guān)。他們“連軸轉(zhuǎn)”了1個(gè)多月,每天工作超過(guò)16個(gè)小時(shí),熬過(guò)數(shù)不清的夜……而他們的目標(biāo)只有一個(gè),希望用科技賦能戰(zhàn)“疫”。
如今,作為抗擊新冠肺炎的“排頭兵”的疾控人,正在和時(shí)間賽跑,在一線(xiàn)戰(zhàn)“疫”的同時(shí),群策群力推動(dòng)應(yīng)急科技攻關(guān)。他們“連軸轉(zhuǎn)”了1個(gè)多月,每天工作超過(guò)16個(gè)小時(shí),熬過(guò)數(shù)不清的夜……而他們的目標(biāo)只有一個(gè),希望用科技賦能戰(zhàn)“疫”。
72小時(shí)采集分析系統(tǒng)
在成都市疾病預(yù)防控制中心新冠肺炎疫情應(yīng)急指揮中心,新冠肺炎密切接觸者采集分析系統(tǒng)發(fā)出新的提示。這套密切接觸者數(shù)據(jù)采集分析系統(tǒng)是成都市疾控中心應(yīng)急與業(yè)務(wù)管理辦公室主任庹曉莉和團(tuán)隊(duì)緊急科研攻關(guān)的成果,從研發(fā)到上線(xiàn),僅僅用了72小時(shí)。
正在運(yùn)行的這套“成都市新型冠狀病毒肺炎病例及密切接觸者實(shí)時(shí)采集分析系統(tǒng)”也是成都市疾控中心承擔(dān)的科技攻關(guān)項(xiàng)目中的重要一部分,得到了成都市科技局的大力支持,在當(dāng)下的疫情防控中發(fā)揮了重要作用。
庹曉莉駐守的成都市疾控中心新型冠狀肺炎疫情應(yīng)急指揮中心,每天要處理大量信息和指令,串聯(lián)起疫情防控公共衛(wèi)生響應(yīng)全鏈條,是疾控指揮調(diào)度及信息匯總分析的樞紐,成都市每日新冠肺炎疫情最新情況的數(shù)據(jù)即來(lái)源于此。每天工作超過(guò)13個(gè)小時(shí),有時(shí)候甚至通宵加班,電話(huà)24小時(shí)在線(xiàn),這早已成為庹曉莉工作的常態(tài)。
對(duì)密切接觸者追蹤管理,是疫情防控中的重要環(huán)節(jié)。如何精準(zhǔn)的做到信息共享和統(tǒng)計(jì)分析,更是成為了疫情決策的關(guān)鍵。
在成都市科技局應(yīng)急攻關(guān)項(xiàng)目的支持下,庹曉莉和團(tuán)隊(duì)當(dāng)機(jī)立斷,決定在已有的疾病監(jiān)測(cè)系統(tǒng)上,新建一個(gè)針對(duì)新冠密切接觸者的實(shí)時(shí)采集分析系統(tǒng)。“時(shí)間就是生命,我們必須分秒必爭(zhēng)。”庹曉莉說(shuō),我和我的團(tuán)隊(duì)每天都見(jiàn)縫插針與研發(fā)團(tuán)隊(duì)商量、討論,修改……目的就是讓這個(gè)系統(tǒng)能夠盡快上線(xiàn)。
庹曉莉駐守的成都市疾控中心新型冠狀肺炎疫情應(yīng)急指揮中心,每天要處理大量信息和指令,串聯(lián)起疫情防控公共衛(wèi)生響應(yīng)全鏈條,是疾控指揮調(diào)度及信息匯總分析的樞紐,成都市每日新冠肺炎疫情最新情況的數(shù)據(jù)即來(lái)源于此。每天工作超過(guò)13個(gè)小時(shí),有時(shí)候甚至通宵加班,電話(huà)24小時(shí)在線(xiàn),這早已成為庹曉莉工作的常態(tài)。
對(duì)密切接觸者追蹤管理,是疫情防控中的重要環(huán)節(jié)。如何精準(zhǔn)的做到信息共享和統(tǒng)計(jì)分析,更是成為了疫情決策的關(guān)鍵。
在成都市科技局應(yīng)急攻關(guān)項(xiàng)目的支持下,庹曉莉和團(tuán)隊(duì)當(dāng)機(jī)立斷,決定在已有的疾病監(jiān)測(cè)系統(tǒng)上,新建一個(gè)針對(duì)新冠密切接觸者的實(shí)時(shí)采集分析系統(tǒng)。“時(shí)間就是生命,我們必須分秒必爭(zhēng)。”庹曉莉說(shuō),我和我的團(tuán)隊(duì)每天都見(jiàn)縫插針與研發(fā)團(tuán)隊(duì)商量、討論,修改……目的就是讓這個(gè)系統(tǒng)能夠盡快上線(xiàn)。
僅僅用了3天時(shí)間,成都市新型冠狀病毒肺炎病例及密切接觸者實(shí)時(shí)采集分析系統(tǒng)1.0版上線(xiàn),它將所有確診病例、疑似病例以及密切接觸者納入一個(gè)完整的數(shù)據(jù)庫(kù),分級(jí)分類(lèi)管理,快速追蹤。
獲取密接者信息的速度大大加快了;密切接觸者追蹤管理效率大大提高;信息組數(shù)據(jù)采集匯總分析效能大大增強(qiáng);……科技化手段對(duì)疫情防控工作帶來(lái)的效率提升立竿見(jiàn)影。
庹曉莉說(shuō):“目前我們管理的密接者累計(jì)已達(dá)到6000多人,在管的還有數(shù)百余人??梢韵胂螅@么大工作量,如果沒(méi)有這個(gè)信息系統(tǒng),要完成實(shí)時(shí)信息共享和精準(zhǔn)分析,靠再多的人都實(shí)現(xiàn)不了。”
當(dāng)然,努力并沒(méi)有止步于此,庹曉莉和其團(tuán)隊(duì)還在計(jì)劃不斷完善系統(tǒng)功能。“一方面,系統(tǒng)采集信息的功能息需要完善。比如,現(xiàn)在關(guān)注‘返港復(fù)工’人員的情況,我們的系統(tǒng)也會(huì)增加相關(guān)數(shù)據(jù)的采集。另一方面,系統(tǒng)的統(tǒng)計(jì)分析的功能也需要不斷完善,為我們深入分析新冠肺炎疫情特征提供支撐。”庹曉莉說(shuō),下一步,我們還計(jì)劃聚焦數(shù)據(jù)的可視化呈現(xiàn),把“枯燥”的數(shù)字代表的意義表達(dá)出來(lái)。而在未來(lái),其他的傳染病防控,這套系統(tǒng)也將繼續(xù)發(fā)揮重要作用。
5小時(shí)一張“人物關(guān)系圖”
自新冠肺炎疫情爆發(fā)以來(lái),成都市疾控中心流行病學(xué)調(diào)查組副組長(zhǎng)、傳防科副科長(zhǎng)岳勇所帶領(lǐng)的成都市疾控中心流行病學(xué)調(diào)查組,就早已奔波各處醫(yī)院、隔離點(diǎn)。而這樣的現(xiàn)場(chǎng)調(diào)查,每一例短則2-3小時(shí),多則甚至要3-5小時(shí)。隔著密不透風(fēng)的防護(hù)服,艱難的記錄著每一次問(wèn)答,他們只為找到“蛛絲馬跡”,迅速確定所有密切接觸者。
岳勇,先后經(jīng)歷了2009年甲型H1N1流感疫情、2014年西非埃博拉暴發(fā)、中東呼吸綜合征、2017年人感染H7N9禽流感等重大的新發(fā)傳染病疫情處置的他,對(duì)一線(xiàn)傳染病防控有著豐富的經(jīng)驗(yàn)。而這次他和他的團(tuán)隊(duì),也成為了這樣一群在疫情“一線(xiàn)”與時(shí)間、與疾病“賽跑”的疾控人。
岳勇和他的團(tuán)隊(duì),從疫情暴發(fā)以來(lái)就一直沖鋒在第一線(xiàn),白天黑夜連軸轉(zhuǎn),很多時(shí)候都把辦公室當(dāng)家,住在這里。
在本次疾控中心承擔(dān)的成都市應(yīng)急科技攻關(guān)項(xiàng)目中,即提出要“掌握成都市新冠疫情的流行特征”、“通過(guò)典型的聚集性疫情案例,探索分析新型冠狀病毒的傳播模式”……而要弄清這些問(wèn)題,岳勇和他的團(tuán)隊(duì)正在進(jìn)行的流行病學(xué)調(diào)查就至關(guān)重要。
“流調(diào)”即流行病學(xué)調(diào)查。學(xué)術(shù)上解釋為,用流行病學(xué)方法進(jìn)行的調(diào)查研究。主要用于研究疾病、健康和衛(wèi)生事件的分布及其決定因素。通過(guò)這些研究提出合理的預(yù)防保健對(duì)策和健康服務(wù)措施,并評(píng)價(jià)這些對(duì)策和措施的效果。
“目前我們對(duì)新冠病毒的了解有限,還需要不斷的加深認(rèn)識(shí)。這需要我們?cè)陂_(kāi)展流調(diào)中,對(duì)每一個(gè)疑似或者確診病例展開(kāi)調(diào)查,以盡可能細(xì)致地摸清他們的行動(dòng)軌跡,找到其他密切接觸者,并從流行病學(xué)上分析病毒特征,最終形成資料報(bào)告。”在岳勇看來(lái),“只有這些工作做的越深入,信息越細(xì)致,盡快掌握一手資料,才能為疫情防控提供支撐,并形成有效的防控經(jīng)驗(yàn)。”
來(lái)自岳勇和他團(tuán)隊(duì)提供的“流調(diào)”數(shù)據(jù),是每一天清晨,我們最關(guān)注的信息。“流調(diào)”是一項(xiàng)瑣碎、細(xì)致的工作,但是至關(guān)重要,岳勇和他的團(tuán)隊(duì),如今依然“戰(zhàn)斗”在疫情一線(xiàn), 而他們形成的一個(gè)個(gè)“流調(diào)”報(bào)告,也正在為科研攻關(guān)提供著有力的數(shù)據(jù)支撐。
用GIS系統(tǒng)探索病毒時(shí)空分布規(guī)律
在疾控中心微檢科收樣室,成都市疾控中心科研教育信息管理科副主任杜長(zhǎng)慧在緊張有序?qū)徸x區(qū)縣隨同標(biāo)本一起上交的流調(diào)報(bào)告的間隙,還在抓緊時(shí)間構(gòu)思測(cè)試GIS技術(shù)和時(shí)空分析方法在疫情防控中如何發(fā)揮作用。
在他的電腦屏幕上,顯示的是一張成都市地圖,而他所做的,正是希望把新冠病毒的時(shí)空分布規(guī)律在地圖上展示出來(lái),為我們更好了解新冠病毒的地域傳播,提供一個(gè)新的破題思路。
為了進(jìn)一步提高流調(diào)報(bào)告的質(zhì)量,杜長(zhǎng)慧在收樣室審讀上送標(biāo)本的流調(diào)報(bào)告,溝通區(qū)縣流調(diào)人員補(bǔ)充報(bào)告中需要完善的地方。從大量的流調(diào)報(bào)告中,杜長(zhǎng)慧發(fā)現(xiàn)被調(diào)查對(duì)象的個(gè)體傳播軌跡迫切需要一種展示技術(shù),他邊審讀報(bào)告,邊整理個(gè)體傳播軌跡的表現(xiàn)形式,一遍又一遍用各種GIS方法和技術(shù)進(jìn)行研究和測(cè)試,以期盡早給出一套成熟的展示技術(shù)用于現(xiàn)在的疫情防控。
作為牽頭人之一,杜長(zhǎng)慧和團(tuán)隊(duì)成員已完成了大量的方法和技術(shù)測(cè)試和準(zhǔn)備,數(shù)據(jù)整理和分析也在有序開(kāi)展。據(jù)杜長(zhǎng)慧介紹,此前團(tuán)隊(duì)也計(jì)劃在成都地區(qū)諾如病毒的分子流行病學(xué)研究引入GIS系統(tǒng),以研究病毒進(jìn)化時(shí)空分布規(guī)律,已積累了一定的研究基礎(chǔ),此次也希望通過(guò)這項(xiàng)技術(shù)為新冠疫情防控提供幫助和支持。
與此同時(shí),經(jīng)過(guò)前期收集病例和密接的流行病學(xué)信息、采集病例的標(biāo)本,微生物檢驗(yàn)科將建立基因測(cè)序方法,挑選合格標(biāo)本進(jìn)行測(cè)序與進(jìn)化分析,整理并數(shù)字化流調(diào)信息。最終,在GIS系統(tǒng)和分子溯源技術(shù)的助推下,將有望展示新冠病毒的傳播模式及病毒進(jìn)化的時(shí)空分布規(guī)律。
一環(huán)扣一環(huán)的科技攻關(guān),將不僅為我們探索新型冠狀病毒的傳播機(jī)制提供研究基礎(chǔ),也將為未來(lái)疫情防控與政府決策提供科學(xué)依據(jù)。(溫彩苓)